2008年10月18日，國務院下發了《國務院關于同意設立廣州南沙保稅港區的批復》，南沙保稅港區于2008年10月獲國務院批復，這是繼2005年6月以來，上海洋山、天津東疆、大連大窯灣、海南洋浦、寧波梅山、廣西欽州、廈門海滄、青島前灣保稅港區后，由國務院批準設立的國內第9個保稅港區。南沙港保稅區的相關優惠政策如下：

稅收政策

1、境外入區的貨物（按有關規定需征稅的貨物除外）免征進口關稅和海關代征稅；

2、區內運往境外貨物免征出口關稅；

3、運往區外的優惠貿易協定項下貨物可申請享受優惠稅率；

4、保稅港區流轉貨物不征收進出口環節的有關稅收；

5、出口貨物和部分入區使用物品“入區即退稅” 和“入區即結匯”；

6、區內物品更換國產零配件可退稅；

7、區內企業生產出口貨物所耗用的水、電、氣，準予退還所含的增值稅。

加工貿易政策

1、區內企業不實行加工貿易銀行保證金臺帳和合同核銷制度；

2、允許“發外加工”；

3、區內加工貿易貨物監管實行以查代核。

保稅政策

1、區內與境外之間進出的貨物予以保稅；

2、與其他保稅監管場所之間往來的貨物實行保稅監管；

3、保稅港區貨物不設存儲期限。

貨物進出政策

1、保稅港區與境外之間進出的貨物不實行進出口配額、許可證管理；

2、區內商品展示免于辦理展覽審批手續，區外展覽辦理暫時進境手續；

3、區內貨物可以自由流轉；

4、可開展出口機電產品的售后維修業務；

5、區內進口貨物不受“三個月”的限制；

6、企業可以選擇申報地；

7、區內企業可以辦理集中申報。

外匯管理政策

1、享受保稅監管區域相關的外匯管理政策；

2、區內企業可以選擇人民幣或外匯結算；

3、區內企業與境外之間貿易不需辦理收付匯核銷手續。